大家可能听说过“空间索引(Spatial Index)”,但它究竟是什么?它能为我们的分析工作带来怎样的革命性变化?
科研人员搜集了来自NCBI、European Bioinformatics Institute (EBI) 、 China National Center fo...
比如2021-GSE158328-肠道发育的,自己下载 GSM4797916_A1.tar.gz ,然后解压可以看到它每个样品其实有两个文件夹 :
A particularly useful solution of the wave equation is a wave with a particular ...
无监督域适配在各种计算机视觉任务重很关键,比如目标检测、实例分割和语义分割。目的是缓解由于域漂移导致的性能下降问题。大多数之前的方法采用对抗学习依赖源域和目标域...
空间数据存储在CARD_obj@spatial_countMat和CARD_obj@spatial_location中,scRNA-seq数据以singlece...
在空间转录组|数据读入,标准数据形式外,还有哪些"天残地缺"可以读取提到了多种形式的数据读取,在原函数Load10X_Spatial的基础上进行了 “简陋”的修...
本节会在spaceranger处理fastq,Seurat处理标准数据(h5 + spatial文件夹)外,额外提供以下几种情况如何处理
A spatial relationship associates two objects according to their relative locati...
Background Network Distance In many real applications accessibility of objects i...
大家好我是费老师,geopandas作为我们非常熟悉的Python GIS利器,兼顾着高性能和易用性,特别是在其0.12.0版本开始使用全新的shapely...
近日,Cell在线发表的论文 “Spatial Transcriptomics and In Situ Sequencing to Study Alzheime...
近年来,单细胞和空间组学技术快速发展,多年被Nature Methods评为年度技术,且在生命科学领域得到广泛应用。为了帮助大家更高效、更快速地了解单细胞空间组...
.近年来,单细胞和空间组学技术快速发展,多年被Nature Methods评为年度技术,且在生命科学领域得到广泛应用。为了帮助大家更高效、更快速地了解单细胞空间...
文章目录[隐藏] 索引类型 索引方法 使用建议 索引类型 类型 名字 描述 normal 普通索引 大多数情况下都可以使用 unique 唯一索引 表示唯一的...
大部分我们处理的降水、气温等栅格数据的格式是nc形式,需要我们将他转换成栅格数据并导入至Arcgis中,进行下一步操作。
CycleMLP由香港大学、商汤科技研究院和上海人工智能实验室共同开发,在2022年ICLR上发布。
空间转录组学研究正在达到单细胞空间分辨率,数据通常来自多个组织切片。《Genome biology》发表了一种计算方法BASS,支持单细胞分辨率空间转录组学的多...